渤海沉积物反硝化细菌nirS功能基因的多样性研究.pdf_第1页
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文档简介

1、本文对渤海沉积物反硝化细菌nirS功能基因的多样性进行了研究。为了解渤海反硝化细菌群落的结构与分布情况,以功能基因nirS为分子标记构建渤海沉积物中反硝化细菌的基因文库,再结合渤海沉积物间隙水的环境因子来研究。渤海6个站位总共筛选了524个nirS基因的有效克隆,每个站位根据DNA酶切带型划分的OTUs的种类数也在50~65之间,最相似序列的相似度在71%~100%之间,显示了较高的物种多样性;使用软件DOTUR分析后共得到94个OTU

2、s(AA5%cutoff),利用NCBI数据库中86个最相似的氨基酸序列作为参考序列,用PHYLIP(version3.69)软件包构建系统进化树,包括长江口和东海海域、胶州湾、海河、珠江、养殖水体、太平洋海域、森林土壤湿地、沿海的含水层和沿海沉积物的nirS序列;将其划分为两个大簇,第一簇分为4个亚簇;对渤海各站位进行UniFrac聚类分析,包括Cluster Environments、Jackknife Cluster和PCoA聚类

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